Wird es in 2017 nun noch Nachtzugverbindungen geben? und wenn ja, welche?

JA, nur nicht mehr den City Nightline der DB.

Wien - (mit Zugtrennung in Nünberg) - Düsseldorf/Hamburg fährt die ÖBB ja schon lange.
.
Darüber hinaus sind in den Pressemitteilungen mindestens 4 Verbindungen die die ÖBB dann
fahren möchte genannt .. da gehörte auch die Rheinlinie Amsterdam Basel - (Zürich?) dazu,
darüber hinaus erwägt die ÖBB auch weitere über diese hinaus fahren zu wollen.
Dies ist jedoch Pressemitteilungen entnommen, so das abgewartet werden sollte was kommt,
alles weitere dazu wäre hier jetzt nur Spekulation.

In dem Sinne nach dem Link welche jedoch keine offizielle Quelle darstellt.

EN 490/491: Hamburg – Nürnberg – Passau – Wien
EN 40490/40421: Düsseldorf – Frankfurt – Nürnberg – Passau – Wien
EN 420/421: Düsseldorf – Frankfurt – Nürnberg – Augsburg – München – Kufstein – Innsbruck
EN 40420/40491: Hamburg – Nürnberg – Augsburg – München – Kufstein – Innsbruck
EN 470/471: Zürich – Basel Bad – Frankfurt – Erfurt – Berlin – Hamburg
EN 294/295, EN 40463/40236, EN 40295/40235: München – Salzburg – Rom/Venedig/Mailand

Die Bahn will wohl einfach keine Nachtzüge mehr machen, siehe z.B. hier: http://dmm.travel/news/artikel/lesen/2016/08/nachtzuege-b...
Zum Glück übernimmt die ÖBB ja einiges, allerdings keine rein innerdeutschen Verbindungen, weil das organisatorisch schwierig ist. Es gibt auch noch einen wöchentlichen Nachtzug von Berlin nach Paris, der von der russischen Bahn betrieben wird. Hier weiß ich aber nicht, ob der für die Strecke Berlin nach Paris gebucht werden kann. Siehe z.B. hier: http://www.zeit.de/reisen/2015-04/nachtzug-rzd-moskau-ber...