Schließt "Stuttgart + City" die Fahrt von Stuttgarter Hbf nach Ludwigsburg ein? (BC 25)

Nein, nur die Zonen 10 und 20 sind eingeschlossenen.

http://www.vvs.de/download/Tarifzonenplan.pdf

Wenn Sie mit der S-Bahn fahren, wäre Zuffenhausen noch im City-Ticket, so dass erst ab Zuffenhausen bezahlt werden muss.

Nein.

Das Cityticket gilt in Stuttgart in den VVS-Tarifzonen 10 und 20, die das gesamte Stadtgebiet abdecken.
Ludwigsburg gehört nicht zum Stuttgarter Stadtgebiet und liegt in der Tarifzone 34.

Es wäre günstiger, direkt eine durchgehende Fahrkarte München - Ludwigsburg zu buchen.

Das geht sogar praktisch, allerdings nur im Navigator. Das Ticket gilt allerdings nur 3 Stunden, also erst kurz vor Stuttgart buchen.